Single nucleus RNA-seq of the nucleus basalis of Meynert

Presentación de charla impartida como parte del curso intensivo de Bioinformática y Estadística de la Licenciatura en Ciencias Genómicas

Transcript

1. Single nucleus RNA-seq of the nucleus basalis of Meynert Presentado por Gabriel Ramírez-Vilchis
2. Cómo empezó mi estancia en el lab… LCG, 2021 Curso de RNAseq, 2025 Estancia remota, 2025-Actual
3. Curso de scRNA-seq https://www.youtube.com/playlist?list=PLwa0ZAE6DJg6j0QEgtgzQwi5xsz6po22E
4. Enfermedad de Alzheimer (AD) ▪Causa principal de demencia globalmente en individuos mayores de 65 años de edad. ▪Aún no se conocen los genes causales y los mecanismos que participan en la patogénesis del AD.
5. APOE ▪Papel central en el transporte y metabolismo de lípidos. ▪Se asocia con enfermedades cardiovasculares, accidentes cerebrovasculares y neurodegeneración.. (Crespo-Lopez, 2018)
6. Núcleo basal de Meynert (NbM) • Es uno de los principales núcleos colinérgicos del prosencéfalo humano. • Presenta una pérdida de aproximadamente 50% de neuronas colinérgicas en etapas medias y tardías del AD. (Differences and Implications of Animal Models for the Study of Alzheimerʼs Disease, s/f)
7. Objetivos del proyecto ▪Estudiar la biología molecular de las células NbM en el contexto del riesgo genético de AD en individuos presintomáticos que entran en la edad de riesgo. ▪Definir dos características centrales de cada genotipo y ascendencia: 1) composición celular y 2) expresión genética diferencial.
8. Single-nucleus RNA-sequencing
9. El papel de la bioinformática
10. El papel de la bioinformática
11. Lo que he aprendido ▪Teoría de análisis de single-cell RNAseq ▪Trabajo colaborativo a distancia ▪Gestión de proyectos en GitHub y servidor ▪Conocer estrategias de trabajo en labs de bioinformática
12. ¡GRACIAS!
13. Referencias ▪ Crespo-Lopez, M. E. (2018). Role for apolipoprotein E in neurodegeneration and mercury intoxication. Frontiers in Bioscience, 10(1), 229–241. https://doi.org/10.2741/e819 ▪ Differences and Implications of Animal Models for the Study of Alzheimerʼs Disease. (s/f). Http://Www.Eurekaselect.Com. Recuperado el 11 de febrero de 2026, de http://www.eurekaselect.com/chapter/12526