Upgrade to Pro
— share decks privately, control downloads, hide ads and more …
Speaker Deck
Features
Speaker Deck
PRO
Sign in
Sign up for free
Search
Search
外国語文献購読 (Purification and properties of phenoli...
Search
Ikko Eltociear Ashimine
July 22, 2024
Science
0
18
外国語文献購読 (Purification and properties of phenolic acid decarboxylase from Candida guilliermondii)
学部の時に使用した文献紹介の資料
元の論文は以下
(
https://link.springer.com/article/10.1007/s10295-011-0998-4
)
Ikko Eltociear Ashimine
July 22, 2024
Tweet
Share
More Decks by Ikko Eltociear Ashimine
See All by Ikko Eltociear Ashimine
OSS活動はいいぞ
eltociear
0
57
AI駆動開発 〜 生成AIが導く未来の開発手法
eltociear
0
88
初めての管理職での大失敗談
eltociear
0
93
上半期でやったこと
eltociear
0
73
呼ばれたのでカンファレンスに登壇してみた結果…
eltociear
0
68
深海微生物の結晶セルロース分解酵素に関する研究
eltociear
0
27
伊豆赤沢海洋深層水から分離された微生物が生産するアラビノキシラン分解酵素に関する研究
eltociear
0
24
Boost The Performance with Codon
eltociear
0
130
Copilot Workspaceで“管制官”になろう!
eltociear
1
800
Other Decks in Science
See All in Science
はじめての「相関と因果とエビデンス」入門:“動機づけられた推論” に抗うために
takehikoihayashi
17
6.8k
Coqで選択公理を形式化してみた
soukouki
0
200
20分で分かる Human-in-the-Loop 機械学習におけるアノテーションとヒューマンコンピューターインタラクションの真髄
hurutoriya
5
2.3k
ultraArmをモニター提供してもらった話
miura55
0
190
最適化超入門
tkm2261
14
3.3k
マテリアルズ・インフォマティクスの先端で起きていること / What's Happening at the Cutting Edge of Materials Informatics
snhryt
1
130
The thin line between reconstruction, classification, and hallucination in brain decoding
ykamit
1
950
General Parasitology
uni_of_nomi
0
120
DEIM2024 チュートリアル ~AWSで生成AIのRAGを使ったチャットボットを作ってみよう~
yamahiro
3
1.3k
Презентация программы бакалавриата СПбГУ "Искусственный интеллект и наука о данных"
dscs
0
720
理論計算機科学における 数学の応用: 擬似ランダムネス
nobushimi
1
340
大規模言語モデルの開発
chokkan
PRO
84
33k
Featured
See All Featured
Performance Is Good for Brains [We Love Speed 2024]
tammyeverts
6
410
Documentation Writing (for coders)
carmenintech
65
4.4k
Build The Right Thing And Hit Your Dates
maggiecrowley
33
2.4k
10 Git Anti Patterns You Should be Aware of
lemiorhan
654
59k
Statistics for Hackers
jakevdp
796
220k
Speed Design
sergeychernyshev
25
620
Making Projects Easy
brettharned
115
5.9k
ReactJS: Keep Simple. Everything can be a component!
pedronauck
665
120k
How to Think Like a Performance Engineer
csswizardry
20
1.1k
StorybookのUI Testing Handbookを読んだ
zakiyama
27
5.3k
The World Runs on Bad Software
bkeepers
PRO
65
11k
Building Flexible Design Systems
yeseniaperezcruz
327
38k
Transcript
Purification and properties of phenolic acid decarboxylase from Candida guilliermondii
採取した6H2N誘導細胞 生理食塩水溶液で二回洗浄し、緩衝液※1中に放置した。 ガラスビーズと共に細胞破砕装置で6回破砕(50s,2,500rpm)した。 12,000×g , 15min 上清 カラム;CM toyopearl 650M
buffer; 20mM 2-モノホリノエタンスルホン酸(MES)緩衝液 活性フラクション カラム;DEAE toyopearl Fast Flow buffer;20mM MES緩衝液 洗浄液;50mM MES緩衝液(50mM NaClを含む) 溶出液;50mM MES緩衝液(50-400mM NaCl) ※リニアグラジエント溶出 濃縮液 カラム;Bio-Gel P-100 Buffer;50mM リン酸ナトリウム緩衝液 溶出液;50mM リン酸ナトリウム緩衝液 限外濾過 buffer;50Mリン酸緩衝液 限外濾過 精製酵素 (-20℃で保存) ※これらの操作は4℃を越えない温度でおこなった
<金属イオンの影響> ・Fe²⁺,Ni²⁺,Cu²⁺,Hg²⁺,は活性を完全に抑制した ・Zn²⁺は29%抑制した ・Ca²⁺,Mn²⁺,Co²⁺,Fe³⁺,Al³⁺の抑制効果は無いか、あってもわずかであった ・Mg²⁺の増加にともないFAとPCAに対する脱炭酸活性は増加した (最大活性は陽イオンを含まないコントロール活性の、それぞれ180%と153%に達した) <化学試薬の酵素活性影響>
Fig2. Effects of pH and temperature on the activity of
purified CgPAD 測定に用いた緩衝液(◦;酢酸ナトリウム,▲;MES,△;リン酸ナトリウム, •;Britton-Robinson汎用緩衝液) 様々な緩衝液を用いて測定した結果、pH 6.1のときに最大の活性が見られた。 Britton-Robinson汎用緩衝液を用いた結果、5.9が最適pHであった。 4.3以下及び、8.8以上のpHのときは活性が見られなかった。
Fig2. Effects of pH and temperature on the activity of
purified CgPAD 測定条件(◦;MgCl₂存在下, • ;MgCl₂非存在下) FAを基質として用いた際、約25℃で最大の活性が見られ、Mg²⁺イオン存在下で はでは25-30℃で最大の活性が見られた。 試験した温度領域内では活性が2価の陽イオンに刺激されていた。 陽イオン非存在下で、0℃の際も最大の50%以上の活性が測定された。
None
a. FAを加えた時のHPLCの溶出プロフィル FAと4-VGの保持時間はそれぞれ2.83minと3.90min b.PCAを加えた時のHPLCの溶出プロフィル PCAと4-VPの保持時間はそれぞれ2.79minと3.75min
まとめ • この研究で、イオン交換クロマトグラフィーによりC. guilliermondii ATCC 9058由来のPAD(CgPAD)が精製した。 • この酵素は同一サブユニットを持つホモ二量体で他の酵母や細菌の持 つ酵素と類似していた。 •
CgPADは低温に適合し、0℃の際でも至適温度の場合の50%以上の活性 を表した。 • CgPADは他の微生物由来PADsのように熱には不安定であった。 • 重金属イオン及び4-chloromericuribenzoateはCgPADの活性を完全に阻 害した。 • 6H2Nによる過誘導はグラム陰性菌において報告されており、生物が 6H2Nを分解しなければPADsを誘導するように見え、実際HPLCによる測定 で6H2NはC. guilliermondii ATCC 9058によって分解されていなかった。 • C. guilliermondii ATCC 9058が好気的培養している際、FAから4-VGへ,PCA から4-VPへの変換が24時間以内に完了していた。 • 結果、CgPADを用いた反応はフレーバーや香りの前駆体となる4-VG及び 4-VPの工業的生産に応用できると考えられる。