Upgrade to Pro
— share decks privately, control downloads, hide ads and more …
Speaker Deck
Features
Speaker Deck
PRO
Sign in
Sign up for free
Search
Search
oku-slide-20230827
Search
Makito Oku
August 27, 2023
Research
0
150
oku-slide-20230827
漢方処方のエネルギー地形解析
奥 牧人 (富山大学)
2023/08/27
第40回 和漢医薬学会学術大会
Makito Oku
August 27, 2023
Tweet
Share
More Decks by Makito Oku
See All by Makito Oku
oku-slide-20240802
okumakito
0
130
oku-slide-20231129
okumakito
0
130
oku-slide-20230213
okumakito
0
250
oku-slide-20221212
okumakito
0
100
oku-slide-20221129
okumakito
0
170
oku-slide-20221115
okumakito
0
320
oku-slide-20220820
okumakito
0
370
oku-slide-stat1-1
okumakito
0
300
oku-slide-stat1-2
okumakito
0
350
Other Decks in Research
See All in Research
SSII2025 [SS1] レンズレスカメラ
ssii
PRO
2
940
データサイエンティストの採用に関するアンケート
datascientistsociety
PRO
0
970
Computational OT #4 - Gradient flow and diffusion models
gpeyre
0
290
学生向けアンケート<データサイエンティストについて>
datascientistsociety
PRO
0
2.9k
EOGS: Gaussian Splatting for Efficient Satellite Image Photogrammetry
satai
4
240
Self-supervised audiovisual representation learning for remote sensing data
satai
3
210
Mechanistic Interpretability:解釈可能性研究の新たな潮流
koshiro_aoki
1
280
業界横断 副業・兼業者の実態調査
fkske
0
160
最適決定木を用いた処方的価格最適化
mickey_kubo
4
1.7k
Google Agent Development Kit (ADK) 入門 🚀
mickey_kubo
2
990
Towards a More Efficient Reasoning LLM: AIMO2 Solution Summary and Introduction to Fast-Math Models
analokmaus
2
220
GeoCLIP: Clip-Inspired Alignment between Locations and Images for Effective Worldwide Geo-localization
satai
3
240
Featured
See All Featured
Let's Do A Bunch of Simple Stuff to Make Websites Faster
chriscoyier
507
140k
Site-Speed That Sticks
csswizardry
10
660
The Myth of the Modular Monolith - Day 2 Keynote - Rails World 2024
eileencodes
26
2.9k
I Don’t Have Time: Getting Over the Fear to Launch Your Podcast
jcasabona
32
2.3k
The Art of Programming - Codeland 2020
erikaheidi
54
13k
Scaling GitHub
holman
459
140k
How GitHub (no longer) Works
holman
314
140k
Rebuilding a faster, lazier Slack
samanthasiow
81
9.1k
Sharpening the Axe: The Primacy of Toolmaking
bcantrill
44
2.4k
Adopting Sorbet at Scale
ufuk
77
9.4k
Fashionably flexible responsive web design (full day workshop)
malarkey
407
66k
Making Projects Easy
brettharned
116
6.3k
Transcript
漢方処方のエネルギー地形解析 奥 牧人 (富山大学) 2023/08/27 第40回 和漢医薬学会学術大会 1 / 11
利益相反の開示 本発表に関する利益相反はありません。 2 / 11
Outline 背景 目的 方法 結果 まとめと考察 3 / 11
背景 近年、エネルギー地形解析 という新たなデータ解析法が提案され、 fMRIデータや腸内細菌叢データなどに適用されている。 T. Watanabe, et al., Nat. Comm.
(2014). T. Ezaki, et al., Philos. Trans. A (2017). K. Suzuki, et al., Ecol. Monogr. (2021). 増田、生体の科学 (2023). ⼆値の表形式データ エ ネ ル ギ 状態 列5 列4 列3 列2 列1 0 1 0 0 1 ⾏1 0 1 0 1 0 ⾏2 1 1 1 0 0 ⾏3 0 0 0 1 1 ⾏4 4 / 11
目的 漢方処方のデータにエネルギー地形解析を適用し、その有用性を 調べることを目的とした。 甘草 芍薬 大黄 麻黄 杏仁 石膏 桂皮
… 芍薬甘草湯 1 1 0 0 0 0 0 … 大黄甘草湯 1 0 1 0 0 0 0 … 麻杏甘石湯 1 0 0 1 1 1 0 … 麻黄湯 1 0 0 1 1 0 1 … ⋮ ⋮ ⋮ ⋮ ⋮ ⋮ ⋮ ⋮ 5 / 11
方法 一般用漢方製剤製造販売承認基準 のデータを使用 漢方処方は294種類、生薬は181種類 構成生薬の組み合わせが同じ処方は1つにまとめた。 データ解析と結果の可視化にはPythonとCytoscapeを用いた。 エネルギー地形解析 擬似最尤法 (Ezaki, 2017)
でイジングモデルを学習 6 / 11
方法 生薬間ネットワーク の作成 各生薬に対し、その生薬のみをモデルに入力した際の活性度 が0.3より大きな生薬を関連生薬とした。 漢方処方間ネットワーク の作成 各処方に対し、以下の条件を満たすものを関連処方とした。 1. 少なくとも1つの生薬が対象処方と重複するもの
2. 対象処方よりエネルギーが低いもの 3. その中で、対象処方と異なる生薬の数が最小のもの 4. その中で、対象処方へ最も遷移しやすいもの 7 / 11
結果: 生薬間ネットワーク 8 / 11
結果: 漢方処方間ネットワーク 9 / 11
まとめと考察 漢方処方のデータにエネルギー地形解析を適用した。 薬対 やくつい (関連生薬の組) の同定 漢方処方の系統樹の再構成 エネルギー地形解析が和漢薬の分野でも有用 であることが 示された。
10 / 11
ご清聴どうもありがとうございました! 11 / 11